Генеральна військова канцелярія — вищий центральний орган виконавчої влади Гетьманщини, який виник спочатку як канцелярія при гетьманові України Богдані Хмельницькому.
Очолив Генеральну військову канцелярію генеральний писар Іван Виговський (майбутній гетьман України), який підніс значення канцелярії, перетворивши її на важливу складову частину системи управління Українською Гетьманською державою.
У Генеральній військовій канцелярії зосереджувалася військова, політична й міжнародна інформація з усієї України та з-за кордону. В цій установі під керівництвом гетьмана розглядалися й вирішувалися важливі адміністративні питання. Звідси відправлялися численні посольства й гінці. Тут вироблялися і зберігалися державні акти, велося діловодство з усіх сфер внутрішнього й міжнародного життя України.
При гетьмані України Іванові Мазепі Генеральну військову канцелярію очолював генеральний писар Пилип Орлик, видатний державний діяч, політик, дипломат, один з найосвіченіших людей свого часу. Пилипа Орлика також обрали гетьманом, але вже в еміграції.